Кафедра факультетской хирургии была организована в 1970 году на базе Мордовской республиканской клинической больницы. Первым ее заведующим стал кандидат медицинских наук И. И. Клюев. В 1975 кафедра факультетской хирургии переведена в городскую клиническую больницу № 3. Возглавил ее Г. Н. Сарайкин. В разные годы кафедру возглавляли И. Н. Пиксин, Н. К. Аношкин, с 1992 года руководит заслуженный деятель науки РМ, доктор медицинских наук, профессор А. П. Власов. На кафедре работали: доктор медицинских наук, профессор Э.Э. Шепп, кандидат медицинских наук, доцент В. М. Сурин, кандидаты медицинских наук А. И. Денисов, В. Д. Пивкин, И. В. Сорокин, И. И. Гуляев.
В настоящее время на кафедре работают: доктор медицинских наук, профессор О. Ю. Рубцов, кандидат медицинских наук, доцент Ю. П. Степанов, кандидаты медицинских наук, ассистенты Т. А. Муратова, П. А. Власов.
Сотрудники кафедры внедрили в клинику более 10 оригинальных операций и 15 консервативных и эфферентных способов терапии. На кафедре подготовлено 18 докторов и 115 кандидатов наук.